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采用溫度、濕度、紫外線、高頻電及銅絲網過濾器去除霉菌。結晶器生長溫度一般在-6~40℃之間，因此，在低溫貯存中很少見到結晶器生長。熱堿水也可以用來死工具和設備上的霉菌。霉菌的生長和溫度是非常重要的，所以溫度的控制只能適當地使用。
紫外線照射是一種較好的去除霉菌的方法。它不僅能殺菌，還能去除霉菌和臭味。但是這只能在直接照射的部分工作。每立方米0.33-3瓦的紫外線輻射在2米以外的地區照射6小時可死微生物。但紫外光的影響受溫度和濕度的影響。微生物生長溫度越接近常溫，濕度越高，菌除霉能力越強。紫外線促進脂肪氧化，所以使用時要注意。銅絲網過濾器是一種在逆風作用下由銅絲制成的網，可死多個霉菌。
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